氮肥供应过多，阻碍作物生长产生毒性亚硝酸盐，使作物贪青晚熟，生长期延长，植株柔软，易受机械损伤和小麦赤霉病、水稻褐斑病等病害侵袭。大量施用氮肥还会使棉花蕾铃稀少易脱落、甜菜块根产糖率下降、纤维作物产量减少、品质降低等。
　　磷肥施用过量，会促使作物呼吸作用过于旺盛，消耗的干物质大于积累的干物质，造成繁殖器官提前发育，引起作物过早成熟，籽粒小，产量低；对禾本科作物来说，还会造成土壤中的硅被固定，不能吸收，发生茎秆纤细，倒伏及抗病能力差等症状。
　　钾肥过量施用，会造成农作物对镁和钙的吸收量下降，对农作物的生长有阻碍作用；会引起叶菜“腐心病”、苹果“苦痘病”等多种病害的发生；还会造成部分地块有害金属和有害病菌超标，破坏土壤中的营养结构和平衡，降低产量。